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通过NIPT发现了新的霍奇金淋巴瘤血液检测方法

本周的《Lancet Haematology》出版了一个概念性研究结果,这个实验中,研究人员证明,他们能够从被诊断为早期或者晚期的患者中的血液中的无细胞DNA中,发现霍奇金淋巴瘤细胞的基因组失衡。

非侵入性测定法,主要依赖于下一代鸟枪测序的ccfDNA,其可以用于鉴定对治疗反应不明显的患者,并提供以后总有价值的,可以使用的监控治疗效果的手段。

该研究的想法来源于在鲁汶大学医学院进行的一次NIPT实验,在该实验中进行了全基因组拷贝数异常的检测,在进一步的实验中,从同一个女性患者的第二份血液样品中,该结果得到了证实。最终,其被诊断患有早期的霍奇金淋巴瘤。

为了确定该妇女的不正常基因组谱是否与癌症相关,研究人员对其肿瘤进行了活检,该组织包括了恶性细胞,即所谓的霍奇金/里德-斯特恩伯格(HRS)细胞,这是通过荧光原位杂交证实的,之后发现,他们的DNA与血液中的异常DNA具有一些相同的地方。

这一发现表明,血液中的ccfDNA中的一部分是由HRS细胞衍生的,这是一个令人惊讶的发现。

根据研究的主要作者,鲁汶大学的人类遗传学系的教授Peter Vandenberghe的观点,活检的霍奇金淋巴瘤只有一小部分,如淋巴结重大部分是HRS细胞,而这个区域是由非恶性细胞包围的。

当你想要分析这些HRS细胞时,外围的细胞将会成为主要的技术障碍和困难,他说。他们与其他细胞混合在一起,如果你想分析一下HRS细胞基因组的变化情况,你需要先净化它们,但是这是费时的,而且具有技术挑战性,最关键是很难。”

因为有些HRS细胞具有相同的基因组特征,这可以在血液检测中被发现,这是可以实现,但是并不是十分困难的,这种方法有望成为一种替代HRS细胞分析的技术。

为了证实他们的发现,研究人员对另外9例患者进行了ccfDNA测序,这些人中,大多数都是近期在医院使用Illumina HiSeq 2500的快速运行模式诊断患有霍奇金淋巴瘤的。在这些人中,7个人是早期病例,2个是晚期病例。

8名患者中,他们发现了异常的DNA图谱。唯一的阴性结果来源于一名早期患者,这可能是因为该病还没有广泛的分布于该患者体内。

他们通过FISH对患者的HRS细胞进行活检,证明了他们的结果,他们观察到一系列的基因区域,这些区域中反复的出现DNA谱的异常。他们发现,ccfDNA的基因组失衡和在所有FISH实验相对应的染色体区域的拷贝数改变之间,存在着显著的整体一致性。

此外,研究人员在患者开始化疗和放疗后,连续几个星期采集血样并进行了分析,发现在大多数情况下,他们的ccfDNA图谱恢复到正常情况都非常快。

根据Vandenberghe的观点,对于霍奇金淋巴瘤系那个关的基因组异常的血液检测,是有希望应用于临床领域的,特别是在预测治疗反应和治疗后对疾病的检测方面。

霍奇金淋巴瘤占所有淋巴瘤的30%,并且是青少年和年轻成年人中最常见的淋巴瘤类型。该疾病的患者进行化疗后大约有90%的治愈率,但是也有10~15%的一线治疗会失败。如果我们能在疾病的前期将可能失败的患者鉴定出来,这将是十分有益的,这样我们就能够不让他们暴露在不是十分有效的化疗中。 Vandenberghe这样说。

在一线治疗中部分患者观察到了类似的情况,这将会导致之后的毒副作用,包括导致其他类型的癌症。如果你想减少治疗,让我们了解到,什么样的病人能够在较少的治疗条件下痊愈是十分重要的,Vandenberghe说。但是这在现在是不可能的。

在治疗后,ccfDNA谱迅速恢复正常的事实表明,其可以用于检测治疗反应,而这现在主要是通过PET/CT成像进行的。成像是一种非常丰富的技术,但他也有一定的风险-会让患者暴露在辐射中,Vandenberghe说。因此,这种新颖的血液采样方法具有很大的潜力。

然而,像PET/CT扫描一样,基于学测的测序分析,依赖于基因组不同区域的测序数据,而且也不能检测到点突变,因此是不能检测疾病残留的微笑痕迹的,因为它是不够敏感的。

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