在2014年两会上，针对药房托管这一当前医药圈内最热的话题，不少医药行业人大代表纷纷表示反对，认为该模式不符合医药分开的初衷。一位业内人士透露，相关部门对此意见不一，除卫计委不反对外，其他部门都不愿发表看法。

部分人大代表指出，目前不少地方在实行医药分开的过程中，以医院药房托管之名大搞“以药补医”。地方政府主管部门及医疗机构通过行政权力，使托管方成为独家垄断医院药品供应权的单位，并要求药房托管方缴纳巨额的“托管费用”，以房租、管理费、质量保证金等名义收取。这种政府部门及医院通过药房托管的方式，把议价权力转移给有政府资源和社会背景的托管方，是典型的由权力配置市场资源的行为，严重破坏了正常的市场秩序，妨碍公平竞争环境。

2014年2月，康美药业连发公告称，拿下80多家公立医院的药房托管权。另有媒体报道称，华润医药、国药集团、九州通自去年开始都在做医院药房托管业务。

对此，华润医药相关人士日前接受采访时表示，华润医药做的是医药物流延伸服务，非独家的，不排他，不是药房托管。九州通医药股份有限公司副董事长刘兆年也表示：“我们只做药品配送业务。”

全国人大代表、老百姓大药房连锁股份有限公司董事长谢子龙吐露，自己不愿做药房托管的原因在于“一是我做药品零售企业利润非常薄，再给医院40%以上的返点几乎不可能；二是做完药房托管后，还要再给医生回扣，这对准备上市的企业也不利”。谢子龙表示，目前很多药企都想效仿康美药业做药房托管，这样下去会破坏搅乱整个医药行业的秩序。

“药监局要求大家学习研究这一模式。而商务部相关人员曾表示，药房托管只是一种过渡形式，并不支持。因为层次低，形式上还是医院的东西，容易导致不公平竞争，该提成还是提成，只是人工转到药品企业。”上述业内人士指出，关键是看药房托管后，医院是否取消分成，否则还是换汤不换药。