然而从净利润角度来说，供应链则是凤凰医疗利润来源的大头。2013年的数据显示，供应链业务的毛利率为19.2%，凤凰医疗77%的净利来自供应链业务。

所谓“供应链”业务的具体操作模式，是指集团向供应商购买药品、医疗器械以及医用耗材，然后卖给集团旗下医院及诊所。旗下的医院和诊所，多为凤凰医疗所托管的公立医院，如燕化医院集团、京煤医院集团、门头沟区医院以及门头沟区中医院等。

凤凰医疗向包括这几家在内的旗下医院出售药品器械，实现集团的“供应链”收入;向这几家医院提供管理服务，实现“医院管理服务”收入。通过托管，凤凰医疗集团实现了这两块收入的持续盈利。

业内人士指出这种供应链模式的弊端在于，改制企业有可能为了提高自己的利润，虽然采购需经过卫计委主导的各省级招标机构，但其可以选择利润更丰厚的药品。

一位常去门头沟区医院看病的居民告诉记者，区医院经过凤凰医疗的改制之后，服务态度和质量明显提高不少，也减少了排队等候的时间，但她总觉得自己看病的药效大不如前，有一次她带着医生给开的药去301医院向对口大夫进行咨询，被告知该药品由于疗效不足在301医院基本上是不用的。

记者就此问题采访了凤凰医疗，对方表示凤凰医疗采购的药品都是经过国家统一药品招标的，质量上不存在任何问题。此外，对方还表示，凤凰医疗现在之所以还是以供应链营收为主，主要是由于目前处于跟公立医院合作初期医院管理服务收费较低，未来会逐步提高医院管理服务收入，降低供应链收入的比重。

陈向军认为，依靠供应链盈利本身不是公立医院改制的初衷，然而在国内以药养医以及公立医院保持公益性质的情况下，供应链盈利成为了凤凰医疗等大多数医管企业收入的主要来源。这种商业模式本身是不可持续的，国家未来可能会持续降低直至取消药品价格加成，而公立医院的非营利性质又让改制企业无法获得因服务管理提高所带来的实际利润，未来商业资本与公立医院非营利性质的矛盾会进一步拉大。

史立臣分析说，由于国家给公立医院采购原研药品或疗效较好的首仿药品有一定补贴，公立医院会优先采购疗效好价格高的药品，而民营医院由于补贴少甚至没有补贴，只能降低采购标准。四川有一家制药厂，依靠降低药品主要成分的含量，降低药价的方式通过药品招标，这家药企通过了GMP，药品抽检批次也合格，但疗效不够。这是我国药品监管中造成的疏漏，医疗机构采购这类低价药品并不违规。

“供应链模式在一些级别较低的医院尚具有一定的操作空间，但是对于煤炭总医院这样的三级医院则很难说，煤炭总医院最具有盈利性的药事服务(如挂号、诊断、开放等)是最为盈利的，而这一权利基本上掌握在医院大夫手中，因此凤凰医疗此前的供应链模式能否与这些大夫的药方权进行对接还是个问题。”史立臣补充说。

面对供应链模式的风险，一位投资者更是直言不讳地分析说，凤凰医疗这种模式的真正风险，在于国家政策是否会对供应链端开刀，供应链是否应当和医院管理权脱钩?如果最终脱钩，这将会对整个盈利模式产生根本性冲击。第二大风险就是来自集团本身，凤凰医疗要想持续扩大盈利规模，就必须继续“投资-运营-移交”模式扩张医疗网络，不断与新的公立医院合作，这里就涉及到集团本身在网络持续扩张下是否能保持高效的运营管理能力。

“简单点说，医改发展的大方向是降药价提服务，怎么把服务的收益体现出来才符合大方向。因此赚药价利差这种供应链模式未来肯定也是会被改掉的。”这位投资者分析说。