二是企业不履行竞业限制协议，可否免除劳动者对商业秘密的保密义务。企业不履行竞业限制协议构成竞业限制违约行为，劳动者可以通过请求合同履行保护其相关合同权益，但不能免除劳动者对商业秘密的保密义务，因为商业秘密是企业的另一项财产性权利，它是基于商业秘密保护的法律规定产生的。

三是竞业限制协议无效是否免除劳动者对商业秘密的保密义务。总体上说，竞业限制协议与商业秘密保密协议的效力是相互独立的。当然，若从约定看，竞业限制协议无效会导致保密协议当然无效的，可免其保密义务;如果不当然无效，那么劳动者对商业秘密的保密义务仍然存在，违反保密义务实施了披露、使用原企业商业秘密等侵权行为的，需要承担相应的侵权责任。

从程序上看，竞业限制和保护商业秘密的关系问题实际是纠纷性质和类别问题。与这两个问题有关的纠纷可能呈现三种情况：

一是单纯的竞业限制纠纷(即上文提到的前两种情况)，

二是单纯的侵害商业秘密纠纷，

三是既涉及违反竞业限制义务又涉及侵害商业秘密的纠纷(即上文提到的后两种情况)。

第一、二类纠纷实际上比较简单，第一类归入劳动争议合同纠纷中，第二类归入侵害商业秘密纠纷中，第三类案件则要根据案件本身的具体情况来判断。若存在商业秘密并构成侵权的情况下，可以归入到侵害商业秘密纠纷案件中处理。在案件处理过程中，主要审查是否构成商业秘密侵害，当然也要审查是否违反竞业限制，但主要的问题还是审查是否侵害商业秘密。假如商业秘密不存在或者不构成商业秘密侵权，仅仅是一个竞业限制纠纷，应属于上述第一类纠纷的情况，归入劳动争议合同纠纷的范围。